前身为“关东都督府满蒙物产馆”，和台北市的台湾博物馆相比，无论是创设目的、功能、建筑和内饰风格、还是馆内日本探险家的特殊馆藏，都有非常多的相似之处。旅顺博物馆和整个满蒙的殖民模式，都借鉴了儿玉源太郎在台湾的成功范式。但是与建造“模范殖民地”台湾的愿景相比，晚近设立的关东殖民区，“掠夺”和“殖民”的色彩更加浓重且不加掩饰，大谷光瑞在中国的考古工作与鸟居龙藏、森丑之助等探险家前辈在台湾的人类学研究相比，更多了几分日本政府的“官方背景”。旅顺博物馆现存国家一级文物200多件，甚至超过了很多省级博物馆，馆内的新疆文物、甲骨文文物和明清宫廷档案能留存至今，少不了大谷光瑞和“汉奸”罗振玉的重要努力。因其日据经历，它在大陆的地位更显特殊。与台北的台湾博物馆相似，旅博也是日本在华殖民政策的重要见证物。